絕大部分的皮膚病靠肉眼就能診斷，有經驗的皮膚科醫師一看就知道病症是什麼，甚至從患者的描述中就能判斷。但有時候病症比較複雜，只靠雙眼畢竟不夠，這時候會需要其他的輔助檢查。

皮膚科最獨特的檢查之一就是皮膚切片，皮膚切片會切下一小塊皮膚，然後製作成特殊的標本，再以顯微鏡檢視。這種檢查可以得到很多皮膚深層組織變化的資訊，有些疾病最後還是必須靠切片來做確定診斷。然而因為切片比較侵入性、又會留下疤痕，通常是非常必要才會這樣做。

其次是皮膚抹片，在用刀片刮取皮膚表面的淺層組織(皮屑、水泡..等)後，加入輔助用的特殊藥劑後以顯微鏡觀察。常見的皮膚抹片有氫氧化鉀抹片 (KOH smear)、Tzanck smear、葛蘭式染色 (Gram stain) 等，可用來協助診斷黴菌感染、疥瘡 (Scabies) 、水泡疾病、以及細菌感染。皮膚抹片快速而且沒有侵入性，是皮膚科醫師的好朋友。

皮膚科醫師還有一種特別的武器叫「皮膚鏡 (Dermoscope)」，這種儀器可以看穿表皮，了解淺層真皮的色素及血管分佈，早年主要用來診斷皮膚癌(黑色素細胞癌)，然而隨著技術的發展，慢慢被應用到各式疾病的診斷上。

還有一種裝置叫伍氏燈 (Wood's lamp)，這是一種特殊波長的紫外線，在伍氏燈的照射下，有些特殊的感染會發出特有的顏色，而且可以加強表皮與真皮間的色差，協助白斑等色素疾病的診斷。

皮膚科醫師最想要的檢查是可以「看得深又不傷身體」，也就是希望看得到皮膚深層的變化、又不必像切片一樣造成傷口。歷史最悠久的算是超音波，但隨著科技發展，還有很多新的技術，比如說光學同調斷層掃描 (Optical coherence tomography)、反射共軛焦顯微鏡 (Reflectance confocal microscopy)、雙光子成像 (Dual photon imaging) 等，都能達到類似的目的。

當然有時候為了檢查是否有全身性的變化，皮膚科醫師也會安排抽血檢驗，比如說看血球、肝臟腎臟的變化、免疫指數、病毒抗體等等。

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